Aperto al pubblico nel marzo del 1996, nei locali posti al secondo piano del settecentesco Palazzo Lepri, già sede comunale, il museo Civico di Bevagna è articolato in tre sezioni: una sezione archeologica, con reperti di età arcaica, repubblicana e imperiale, provenienti dall'antica Mevania, quali epigrafi, urne cinerarie e sculture marmoree; una sezione documentaria rappresentata da documenti pergamenacei medievali ed una sezione pittorica con dipinti databili tra XVI e XVIII secolo provenienti dalle numerose chiese della città. Fra questi l'Adorazione dei Magi di Corrado Giaquinto, la Madonna col Bambino di Dono Doni e i dipinti degli artisti bevanati Andrea Camassei e Ascensidonio Spacca, rispettivamente, i Santi Carlo Borromeo e Filippo Neri e la Cassa con i miracoli del beato Giacomo. Completano la documentazione artistica tra il '700 e l'800 artisti come G.B. Pacetti, G.B. Michelini, V. Angeli e C. Lamparelli.

Al piano terra statue, iscrizioni, monete ed altri reperti archeologici integrano la cospicua raccolta settecentesca, murata lungo le scale del palazzo, e documentano l'importanza dell'antico municipio romano. E’ stato istituito un circuito turistico, al quale si accede previo pagamento di un biglietto unico, per la visita al Museo civico, al Teatro Comunale e all’edificio delle terme romane.